菏澤學院在山東省內屬于標準的二本高校（按原來的一本、二本、三本進行劃分的話），是由原菏澤師專、菏澤教育學院、菏澤電大、菏澤師范、菏澤農校五校合并的，2004年正式升格為本科高校，目前學校沒有碩士點，還不是碩士學位授予單位，自然更沒有保研的資格。

學校的師資力量一般，高層次人才較少，特別是“江、河、湖、海、山”等具有帽子稱號的學者不多，不過教個普通本科生的問題還是不太大的。重點學科、科研平臺的實力一般，數量也較少，取得的重大科研成果也不太多，是一所標準的教學型高校。

菏澤學院近些年來一直在謀求碩士點和升格大學兩大目標，但是難度都非常大，特別是升格大學這一目標，目前來看還遙遙無期。按照規定，2020年國家將開展新一輪碩士學位單位增列，菏澤學院申報的可能性較大，但成功的可能性不高，主要是山東交通學院、濟寧醫學院、山東政法學院、濰坊學院、濱州學院、德州學院也都虎視眈眈，都想拿下這個寶貴的名額。通常情況下，只有取得了碩士學位授予權，且有5屆以上碩士畢業研究生才有資格申報更名大學（特例不算）。

最后，從菏澤學院2020年在山東省內的錄取分數線上來看一下，整體處于公辦院校的下游，主要生源的位次在14萬至22萬名之間。

不過無論怎么說，這也是一所公辦高校，比絕大多數的民辦高校、獨立學院強多了。對于比本科錄取分數線高了沒有幾十分的考生而言，這是一所值得選擇的高校。