事業編制實行屬地分級管理，事業單位分類改革的大方向雖是精簡機構和編制總數，但總的來說，占大頭的仍是全額撥款單位，如公益一類事業單位等，基本會維持現狀不變，主要通過合并機構、增減職能和嚴控編制數量等方式進行改革，對現有事業編人員影響不大，工作依然夠安穩，待遇還會在改革完成后參照公務員的薪酬改革得到一定幅度的增長。
目前已完成改革的行政類事業單位，部分具備執法職能的已并入行政機關，其參公人員按照“人隨事走”原則轉入行政機關并直接轉為公務員；部分使用事業編制的人民團體和群眾團體，則維持現狀不變，繼續實行參公管理；另外還有一些轉為公益一類事業單位，其在編人員的身份地位和工資待遇等并不會受太大影響。
普遍認為，這次事業單位分類改革受沖擊最大的是差額撥款事業單位和自收自支事業單位。
前者如高校、公立醫院等，原來是政府財政撥款一部分，自收自支統籌一部分，這次改革后將會保留事業單位序列，但取消其在編人員的事業編制身份。有人就擔心其現有在編人員的保障將受影響，以后“鐵飯碗”會變成“瓷飯碗”。
這其實是多慮了，目前已有省份在高校和公立醫院中實行“員額制”，即根據高?；蚬⑨t院現有人員編制和職能任務等情況，核定其一定數額的員額，在員額限額內進行人員招聘、職稱晉升和職務提拔，賦予高校和公立醫院更大自主權，員額內人員的專業技術等級、管理崗等級的比例設置和評聘基本由單位說來算，反而比現在會更有利。
自收自支事業單位多為生產經營類單位，剝離事業單位屬性，轉為企業應是大勢所趨。如出版社、政府招待所和酒店賓館等，因背靠行政機關，業務基本不愁，轉為企業后并非就是壞事，有良好的生產經營收益作支撐，還免除了事業單位發放工資待遇的限制，效益好的單位，其工作人員的工資待遇水平將會明顯提升。