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這兩所學校相比，明顯是新疆大學更好一些。
青海大學與新疆大學，兩所大學都是省屬的211工程大學，但是2017年教育部頒發的雙一流建設方案中，青海大學成為“一流學科”建設高校，新疆大學成為“雙一流”建設B類高校，兩所學校從此站在不同的發展平臺之上，“雙一流”建設B類高校明顯比“一流學科”建設高校層次更高，新疆大學和青海大學的層次已經從211大學的平起平坐，到“雙一流”與“一流學科”的高低有別。下面共同來看一看兩所大學的相關情況。
一、青海大學
青海大學位于青海省會西寧市，青海省屬，由教育部與青海共建高校。青海大學前身是1958年創辦的青海工學院，1960年，青海工學院、青海農牧學院、青海醫學院、青海財經學院合并組建青海大學。文革期間學校停辦，1971年恢復為青海工農學院。1988年學校更名為青海大學，之后又先后合并了青海畜牧獸醫學院、青海省農林科學院、青海省畜牧獸醫科學院、青海財經職業技術學院、青海醫學院。青海大學是省內高校集大成者，唯一的211和一流學科建設高校。學校現有全日制本科生20000多人，全日制博碩研究生1500多人。有教職工4600人，其中醫護和專職科研人員2500多人、專任教師1400多人。
青海大學現有本科專業69個，其中有國家級特色專業6個：化學工程工藝、草業科學、藏醫藥、預防醫學、資源勘查工程、經濟學。
學校有二級學科博士學位授權點5個：作物栽培與耕作學、作物遺傳育種、牧草遺傳與耕作學、內科學（高原醫學方向）、民族醫學（藏醫學方向）。有二級學科碩士學位授權點57個，碩士專業學位授權領域40個。
學校有一流學科建設學科1個：生態學。有國家重點（培育）學科2個：內科學（高原醫學）、作物遺傳育種。
2017年教育部第四輪學科評估，青海大學共有3個學科上榜：作物學C、草學B-、臨床醫學C-。
青海大學雖然是211工程大學和一流學科建設高校，但卻是211大學中專業水平墊底的學校。
二、新疆大學
新疆大學位于新疆自治區首府烏魯木齊，是自治區屬大學，教育部與新疆共建高校。學校前身是1924年創辦的新疆俄文法政專門學校。1935年1月改建為新疆學院，1950年更名為新疆民族學院，1953年合并了西北民族學院畜牧系獸醫班，1954年復名為新疆學院，1960年更名為新疆大學，1978年成為新疆唯一的全國重點大學。1997年合并了新疆工學院。學校現有普通本科生21500多人，碩士研究生6100多人，博士研究生近500人。有教職工3000多人，其中專任教師1900人。
新疆大學共有本科專業94個，其中有國家特色專業10個：化學工程與工藝（石油天然氣）、中國少數民族語言文學、資源勘查工程、數學與應用數學、電氣工程及其自動化、土木工程、機械設計制造及其自動化、自動化、電子信息工程、紡織工程。
學校有一級學科博士學位授權點14個、一級學科碩士學位授權點33個，博士后科研流動站11個，碩士專業學位類別18個。
學校有二級學科國家重點學科2個：中國少數民族語言文學，應用數學。有一流學科建設學科3個：馬克思主義理論、化學、計算機科學與技術。
教育部第四輪學科評估，新疆大學共有16個學科上榜：理論經濟學B-、法學C+、政治學C-、馬克思主義理論B、中國語言文學B-、新聞傳播學C-、數學B、化學B-、地理學C+、生物學C+、生態學C+、機械工程C+、電氣工程C+、計算機科學與技術B-、化學工程與技術B-、軟件工程C+。
兩所學校從專業水平角度來衡量，也不是一個層次的大學。新疆大學學科水平明顯高出很多。多角度綜合比較，肯定還是新疆大學更好。