在Java中，我們可以通過以下步驟生成cer和key證書文件：

1. 生成私鑰key文件：

KeyPairGenerator keyPairGenerator = KeyPairGenerator.getInstance("RSA");
keyPairGenerator.initialize(2048); // 指定密鑰長度
KeyPair keyPair = keyPairGenerator.generateKeyPair(); // 生成密鑰對
PrivateKey privateKey = keyPair.getPrivate(); // 獲取私鑰
OutputStream outputStream = new FileOutputStream("D:/key/test.keystore");
outputStream.write(privateKey.getEncoded());
outputStream.close();

2. 生成證書文件：

X500Name x500Name = new X500Name("CN=Test,OU=Test,O=Test,C=CN");
Date startDate = new Date();
Date endDate = new Date(startDate.getTime() + 3650 * 24 * 60 * 60 * 1000L); // 證書有效期10年
BigInteger serialNumber = new BigInteger(64, new SecureRandom()); // 序列號隨機生成
X509v3CertificateBuilder certificateBuilder = new JcaX509v3CertificateBuilder(x500Name, serialNumber, startDate, endDate, x500Name, publicKey);
ContentSigner contentSigner = new JcaContentSignerBuilder("SHA256WithRSA").build(privateKey);
X509CertificateHolder certificateHolder = certificateBuilder.build(contentSigner);
OutputStream certificateOutputStream = new FileOutputStream("D:/key/test.cer");
certificateOutputStream.write(certificateHolder.getEncoded());
certificateOutputStream.close();

以上是生成cer和key證書文件的完整代碼，其中私鑰文件使用了Java自帶的一對生成器，指定了密鑰長度為2048位。生成證書文件部分使用了BC庫中的X509v3CertificateBuilder類，指定了證書的基本信息，有效期等信息。