在Java中，線程的停止和等待都是常見的操作，常常使用stop()和wait()方法來實現。下面我們來詳細了解一下這兩個方法的應用。

停止線程：
Thread.stop()方法可以在任何時候終止一個線程，但它不被推薦使用，因為它可能會使應用程序的狀態不一致，并且可能會導致不確定的異常。為了安全地終止線程，你應該編寫代碼來確保線程能夠正常地退出，并且不會在終止時保留數據結構或文件系統處于不一致的狀態。

等待線程：

Thread.wait()方法會讓調用線程等待，并釋放線程占用的鎖，直到被通知或被中斷。通知可以通過Thread.notify()方法或Thread.notifyAll()方法來發送，并且只能由持有該對象監視器的線程調用，因此這兩個方法必須在同步塊中被調用。一旦線程被通知，它便可以競爭重新獲得該對象的監視器，并繼續執行。另外，wait()方法還可以帶有一個毫秒級別的等待時間，即在等待時間內如果沒有收到通知，線程將會自動醒來。

綜上所述，stop()方法雖然可以終止線程，但是不推薦使用，因為它可能導致數據結構和文件系統處于不一致的狀態。而wait()方法則被廣泛使用來實現線程等待，但是必須在同步塊中被調用，并且需要和notify()或notifyAll()方法一起使用，才能實現多個線程之間的協作。