DOM和jQuery都是進行HTML文檔操作的工具，但它們在使用方式、功能以及性能等方面存在不同。

//DOM
var element = document.getElementById('my-id'); //獲取元素
element.style.color = 'red'; //改變樣式
element.innerHTML = 'hello world'; //改變內容
//jQuery
var $element = $('#my-id'); //獲取元素
$element.css('color', 'red'); //改變樣式
$element.html('hello world'); //改變內容

從以上代碼可以看出，DOM使用較繁瑣，需要使用getElementById等方法獲得元素對象，然后才能進行后續操作；而jQuery則可以通過$符號和CSS選擇器獲得元素，然后使用方法鏈式操作進行修改，使用更加便捷。

除此之外，jQuery還提供了許多DOM不具備的功能，如動畫效果、事件綁定等。例如，使用jQuery實現點擊按鈕隱藏元素的效果：

//DOM
var button = document.getElementById('my-button');
var element = document.getElementById('my-element');
button.onclick = function() {
element.style.display = 'none';
}
//jQuery
$('#my-button').click(function() {
$('#my-element').hide();
});

可以看到，使用jQuery實現隱藏效果更加簡單明了，代碼量更少。此外，jQuery內部也實現了大量的性能優化，使得在瀏覽器中運行更加高效。

綜上所述，DOM和jQuery在HTML文檔操作上存在差異，使用jQuery可以讓開發更加高效快捷。不過，對于較簡單的頁面操作，DOM仍然是一個不錯的選擇。