MySQL的合并索引是一個非常實用的功能，可以在使用多個索引優化查詢時將它們合并成一個更有效的索引。但是如果合并不當，可能會導致死鎖的情況發生。

死鎖是指在多個事務之間存在相互等待的情況，導致數據庫無法繼續執行操作。當MySQL中使用了合并索引時，如果兩個事務同時請求對同一行數據進行修改，則可能會出現死鎖的情況。這是因為合并索引實際上是創建了一個邏輯上的虛擬索引，而不是一個實際的物理索引。

為了避免死鎖的發生，可以采取以下措施：

1. 對索引進行分散，不要將多個索引合并成一個；
2. 對鎖進行優化，盡可能地使用行鎖而不是表鎖；
3. 對事務進行優化，使用最小的事務隔離級別，如READ COMMITTED。

在實際應用中，我們需要根據具體情況進行合理的索引設計和優化。