MySQL是一款流行的關系型數據庫管理系統。從物理存儲的角度來看，可以將其分為以下幾部分：

1. 數據文件

數據文件是MySQL中存儲數據的主要方式。MySQL會根據用戶的設置在磁盤上創建一個或多個數據文件，在其中存儲數據。數據文件包括了表空間文件、日志文件、臨時文件等。而InnoDB存儲引擎的數據則保存在.frm、.idb和.ibdata文件中。

2. 日志文件

MySQL的日志文件主要有以下兩種：事務日志和錯誤日志。

事務日志是MySQL中最重要的日志之一，它主要用于記錄對數據庫的修改操作，以便在出現故障時進行恢復。MySQL支持多種不同的事務日志模式，例如二進制日志模式、XtraDB/InnoDB日志模式等。

錯誤日志則用于記錄MySQL在運行過程中出現的錯誤信息。這種日志可以幫助管理員快速定位系統問題，從而提高系統可用性。

3. 索引文件

索引文件用于提高查詢性能。MySQL支持不同種類的索引結構，例如B樹、B+樹等。

每當向表中插入一條記錄時，MySQL會根據設計的索引結構創建相應的索引文件，以便加速后續的查詢操作。同時，MySQL還支持在線創建、更改和刪除索引，以提高系統的靈活性和可維護性。

4. 啟動文件

MySQL的啟動文件用于指定MySQL在啟動時需要的各種參數和配置設置。這些設置包括了數據庫的名稱、文件夾的路徑、緩存大小、服務器語言等。

管理員可以按照自己的需求對這些啟動參數進行配置，以滿足不同的業務場景和應用環境。

綜上所述，MySQL是通過數據文件、日志文件、索引文件和啟動文件等組成部分實現數據存儲和管理的。管理員可以根據不同的應用需求對這些文件進行優化和調整，從而提高系統的性能、可用性和可維護性。