MySQL是一種開源的關系型數據庫管理系統，而H2是一種基于Java的關系型數據庫管理系統。在使用這兩種數據庫時，我們需要考慮它們的兼容性問題。

雖然這兩種數據庫有一些相似之處，但它們的兼容性還是存在一些問題的。下面我們來詳細了解一下。

H2兼容性問題：
1. H2不支持MySQL的所有語法和函數，也不支持大部分MySQL的存儲引擎；
2. 在H2中使用MySQL的日期和時間函數會報錯；
3. H2對MySQL的外鍵和索引支持不夠好，有些情況下需要重新設計表結構；
4. 在H2中使用MySQL的命令時，需要進行轉義處理，否則H2會認為這是自己的語法。
MySQL兼容性問題：
1. 在MySQL中建立的存儲過程和觸發器無法在H2中運行；
2. MySQL中日期和時間的精度和H2略有不同，會影響數據的存儲和轉換；
3. MySQL與H2對SQL標準的支持存在差異，有些SQL語句在MySQL中運行正常，在H2中就會出錯；
4. 在MySQL中使用的一些函數和命令在H2中可能不存在，需要使用不同的語法實現相同的功能。
總結：
使用H2和MySQL時需要考慮它們的兼容性問題，特別是在切換數據庫時需要仔細檢查和測試代碼。在實際項目中，我們應該根據實際情況選擇合適的數據庫，并針對不同的數據庫做出相應的設計和優化。