首先，MySQL 5.1是一個相對較老的版本，于2008年發布。它是MySQL 5.x系列的第一個穩定版本，具有良好的穩定性和可靠性。然而，它的性能和功能相對較弱，尤其在大型數據庫的處理方面表現不佳。

noDB存儲引擎的改進以及更好的索引優化等功能，使得它在處理大型數據庫時表現更為出色。

因此，總的來說，MySQL 5.6比MySQL 5.1更好用。當然，具體的選擇還應該根據實際情況進行考慮。如果你的應用程序對MySQL版本的要求不高，那么MySQL 5.1也可以滿足需求。但是，如果你需要更好的性能和更多的功能，那么MySQL 5.6是更好的選擇。

總之，對于MySQL版本的選擇，應該根據實際需求進行考慮，選擇最適合自己的版本。