geo功能分析？

我們的目標(biāo)是要從讀懂文獻(xiàn)到復(fù)刻文獻(xiàn)實(shí)驗(yàn)，再到掌握GEO數(shù)據(jù)挖掘的能力。首先便是要廣泛閱讀，在讀文獻(xiàn)時，提煉脈絡(luò)，讀懂文獻(xiàn)使用了哪個或哪些GSE數(shù)據(jù)集，對數(shù)據(jù)做了哪些處理。了解清楚后，便可下載相應(yīng)的數(shù)據(jù)集，得到表達(dá)矩陣，作差異分析，注釋等一系列下游分析。一篇文章可以有一個或多個GSE數(shù)據(jù)集，一個GSE里可以有一個或多個GSM樣本。多個研究的GSM樣本可以根據(jù)研究目的整合為一個GDS，每個數(shù)據(jù)集有著自己對應(yīng)的芯片平臺（GPL），一個GSE里可能有多個平臺測出的數(shù)據(jù)。本分析是基于R語言的平臺，所以需要一些R語言的基礎(chǔ)知識。