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igv軟件如何使用

錢良釵2年前19瀏覽0評論

igv軟件如何使用?

1、使用igvtools 將*.bam文件轉換成相應的*.tdf文件(節省空間),*.tdf文件有其對應的可查看的文本*.wig文件。

在大型機上將igvtools壓縮包上傳到個人工作目錄,解壓,然后在.bashrc_programs中加載包的路徑即可使用。格式轉換命令如下:

igvtools count -z 5 -w 25 *.bam *.bam.tdf hg19

igvtools count -z 5 -w 25 *.bam *.bam.wig hg19

(help文件說tdf和wig可以同時轉,中間用逗號隔開即可)