在PHP的應用程序開發過程中，exec命令是一個非常常用的函數，可以方便的執行一些外部的系統命令，例如執行系統命令、調用Python、各種PHP擴展動態庫以及一些執行shell命令等。但是，在執行exec函數時，由于其存在一定的安全隱患問題，常常會導致系統受到一些威脅。因此，我們需要有一些相關的措施來保護我們的系統。

首先，我們要提到的就是禁用exec函數。禁用exec函數是一種非常好的保護方法。從php官方的文檔來看，如果有些函數（例如exec和system）被禁用了，會在代碼中直接調用這些函數時拋出致命錯誤，這樣可以防止哪些黑客通過這些函數攻擊系統。我們可以通過以下方法來禁用exec函數。

function disable_exec_func()
{
if(function_exists('exec'))
{
$disable_functions = explode(',', ini_get('disable_functions'));
if(!in_array('exec', $disable_functions))
{
$disable_functions[] = 'exec';
$disable_functions_str = implode(',', $disable_functions);
ini_set('disable_functions', $disable_functions_str);
}
}
}

在上述代碼中，我們通過ini_get()來獲取當前的disable_functions，再使用explode函數將其轉化成數組，最后使用in_array來判斷exec是否已經被禁用了。如果沒有，就將其添加到數組中，并使用implode將其再次轉化為字符串，然后通過ini_set將其設置為全局的禁用函數。這樣，我們就成功的禁用了exec函數。

除此之外，我們還可以通過其他的方式來禁用exec。例如，我們可以直接修改php.ini文件中的disable_functions選項，如下所示：

disable_functions = exec,system,shell_exec,passthru

這樣就可以禁用exec函數以及其它一些常見的函數了。當然，我們也可以通過.htaccess文件來禁用exec函數，如下所示：

php_value disable_functions 'exec,system,shell_exec,passthru'

總之，禁用exec函數是我們保護系統的一項重要任務。雖然它在一些特定的場合下還是很常用的，但是我們需要權衡利弊，權衡自己的需求與系統的安全，來做出一個明智的選擇。在實際開發過程中，我們可以根據自己的需要，來選擇最適合自己系統的保護方式。