PHP CI框架是一種快速開發Web應用的工具，它具有完善的目錄結構。目錄結構的清晰規劃可以幫助開發人員更好地組織代碼和資源，提高開發效率。下面我們來詳細探討一下PHP CI框架的目錄結構。

PHP CI框架的目錄結構包括：application、system、user_guide、tests、index.php。其中，application下是開發人員放置主要應用程序的目錄。在此目錄下，有三個重要的子目錄：config、 controllers 、 models 、views 。

/application
/config
全局配置文件
/controllers
控制器
/models
模型
/views
視圖

config目錄中包含一些全局的配置文件，如數據庫配置、路由配置、全局變量配置等等。controllers目錄中包含控制器，用于處理和響應用戶請求。models目錄中包含模型，用于進行數據庫操作和數據處理。views目錄中包含視圖，用于展示數據和渲染頁面。

除此之外，還有幾個子目錄需要專門介紹一下：

/application
/core
核心類庫的擴展
/helpers
常用函數庫幫助函數
/libraries
第三方類庫
/logs
系統日志文件目錄（默認使用log4php日志工具）

core目錄包含了框架的核心類庫文件，開發人員可以擴展或覆蓋這些類庫，以便滿足特殊的需求。helpers目錄包含常用的函數庫幫助函數，使用這些函數可以方便地進行開發。libraries目錄包含第三方類庫，例如PHPMailer、PHPSecLib等等。logs目錄用來存儲系統日志文件，開發人員可以通過配置、使用日志工具進行記錄和查閱。

在system目錄下，存放著框架的核心文件，這些文件是框架的基礎構成部分，不能修改或刪除。

/system
/core
CI框架的核心類庫文件
/database
數據庫類庫
/helpers
輔助函數類庫
/libraries
核心函數類庫

除此之外，還有一個user_guide目錄和一個tests目錄。user_guide目錄下是框架的用戶手冊，tests目錄下是框架的測試用例。

最后，我們來看一下index.php文件。這個文件是PHP CI框架的入口文件，它會自動加載框架的核心文件，并根據請求調用相應的控制器、方法和參數。

//index.php文件樣例
require_once('./system/core/CodeIgniter.php');

綜上所述，PHP CI框架的目錄結構非常清晰簡潔。通過合理使用不同的目錄，我們可以將代碼和資源進行合理分離，提高代碼可讀性、可維護性和可擴展性。當然，開發人員可以根據自己的需求進行相應的定制和擴展。