Java工程是指一個基于Java語言開發的項目，它包括Java代碼、資源文件、配置文件、文檔和測試代碼等。在Java工程中，我們通常使用Java SE平臺提供的各種類和接口來實現我們所需要的功能。

public class HelloWorld {
public static void main(String[] args) {
System.out.println("Hello, World!");
}
}

Java EE工程則是基于Java EE平臺的項目，Java EE平臺主要提供了一個標準的開發框架，它集成了許多常用的技術和規范，如Servlet、JSP、EJB、JMS、JPA等。Java EE平臺旨在為企業級應用提供標準化、模塊化和可擴展的解決方案。

@WebServlet("/hello")
public class HelloServlet extends HttpServlet {
protected void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response) throws ServletException, IOException {
PrintWriter out = response.getWriter();
out.println("");
out.println("
Hello, World!
");
out.println("
");
}
}

Java和Java EE工程在很多方面都有相似之處，比如它們都使用Java語言作為開發語言，都需要用到Java編譯器和虛擬機等工具，都可以使用各種開發工具來編寫和管理項目等。但是它們也有很多區別，Java EE工程通常需要依賴于一些Java EE容器（如Tomcat、WebLogic等）來提供運行環境，并使用一些Java EE特有的技術來實現企業級應用需求。