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Python 相場法

阮建安2年前9瀏覽0評論

Python 相場法是一種機器學(xué)習(xí)中的非監(jiān)督學(xué)習(xí)方法,它可以用于聚類分析,異常檢測,特征選擇和可視化等任務(wù)。該方法使用無向圖的形式來表示數(shù)據(jù)集,并對圖中節(jié)點間的相似性進(jìn)行量化。這篇文章將首先介紹 Python 相場法的理論基礎(chǔ),然后提供一個簡單的示例來演示如何使用 Python 實現(xiàn)該算法。

相場法的核心思想是將系統(tǒng)中的相互作用視為場,場的變化驅(qū)動系統(tǒng)中的微觀元素產(chǎn)生相應(yīng)的行為。當(dāng)系統(tǒng)中的微觀元素組成密集的網(wǎng)絡(luò)時,可以使用相場法來分析其網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和屬性。在 Python 中,可以使用 igraph 庫中的 Graph 類來構(gòu)建和可視化無向圖。

下面是一個簡單的 Python 示例,演示如何使用相場法將 Iris 數(shù)據(jù)集進(jìn)行聚類分析:

import numpy as np
import igraph as ig
from sklearn.datasets import load_iris
def calculate_modularity(g, partition):
"""
計算社區(qū)劃分的模塊度
"""
m = g.ecount()
ks = g.strength(loops=False)
q = 0.0
for i in set(partition):
nodes = np.where(partition == i)[0]
if len(nodes) >0:
subgraph = g.subgraph(nodes)
lc = subgraph.ecount()
ld = sum(ks[nodes])
q += lc / m - (ld / (2.0 * m)) ** 2
return q
iris = load_iris()
data = iris['data']
target = iris['target']
labels = iris['target_names']
g = ig.Graph()
g.add_vertices(data.shape[0])
for i in range(data.shape[1]):
values = data[:, i]
mean = np.mean(values)
std = np.std(values)
values = (values - mean) / std
edges = np.column_stack((range(data.shape[0]), values))
edges = edges[edges[:, 1].argsort()]
for j in range(data.shape[0] - 1):
g.add_edge(int(edges[j, 0]), int(edges[j + 1, 0]))
partition = g.community_multilevel()
print("Clusters:", len(partition))
print("Modularity:", calculate_modularity(g, partition.membership))

上述代碼首先導(dǎo)入必要的庫和數(shù)據(jù)集,然后構(gòu)造 igraph.Graph 對象,并根據(jù)數(shù)據(jù)集中每個特征的均值和方差對其進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。然后使用 Graph.add_edge() 函數(shù)將每個數(shù)據(jù)點與其相鄰的點之間添加一條無向邊。最后使用 community_multilevel() 函數(shù)將圖分成若干個社區(qū),并計算分配的社區(qū)劃分的模塊度。

在實際應(yīng)用中,可以使用相場法來探索大型數(shù)據(jù)集中的隱含結(jié)構(gòu)。例如,可以使用相場法來識別基因表達(dá)數(shù)據(jù)中的基因模塊,或者從社交網(wǎng)絡(luò)中預(yù)測用戶的行為模式。如果您對 Python 相場法感興趣并想深入學(xué)習(xí)該主題,請考慮查閱相關(guān)的文獻(xiàn)和教程。