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python 生物 熱圖

Python在生物學(xué)領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用,其中熱圖是常用的數(shù)據(jù)可視化方式之一。熱圖可以用來(lái)展示基因表達(dá)、蛋白質(zhì)互作、藥物作用等各種生物數(shù)據(jù)。

下面是使用Python繪制熱圖的示例代碼:

import seaborn as sns
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# 讀取數(shù)據(jù)
df = pd.read_csv("gene_expression.csv")
# 繪制熱圖
sns.heatmap(df, cmap="YlGnBu")
# 添加標(biāo)題和標(biāo)簽
plt.title("Gene Expression Heatmap")
plt.xlabel("Samples")
plt.ylabel("Genes")
# 顯示圖像
plt.show()

代碼中使用了Seaborn和Pandas庫(kù)來(lái)讀取數(shù)據(jù)和繪制熱圖。首先,我們讀取了一個(gè)名為gene_expression.csv的數(shù)據(jù)文件。接著,我們使用Seaborn的heatmap()函數(shù)來(lái)生成熱圖。cmap參數(shù)可以指定顏色映射,此處使用YlGnBu(黃-綠-藍(lán))色系。

最后,我們添加了標(biāo)題和標(biāo)簽,并使用Matplotlib的show()函數(shù)來(lái)顯示圖像。

熱圖對(duì)于生物學(xué)研究非常有用,它可以使得數(shù)據(jù)處理和分析更直觀、更易懂。Python提供了豐富的數(shù)據(jù)處理和可視化工具,讓生物學(xué)家能夠輕松地探索和理解數(shù)據(jù)。