MySQL是開源的關系型數據庫管理系統，它支持多種操作系統，包括Windows、Linux、Unix等。MySQL安裝后，在系統中會生成一些文件和文件夾，這些文件和文件夾都有其特定的用途，是MySQL正常運行的必要組成部分之一。

其中，MySQL的數據文件存儲在數據目錄中，這個目錄可以手動指定或者默認指定為安裝平臺的默認目錄。在安裝過程中，如果不手動指定數據目錄，MySQL會默認將數據文件存儲在系統的默認目錄中，這個目錄在不同的系統平臺上可能有所不同。在Linux系統上，默認的數據目錄是/var/lib/mysql，在Windows系統上是C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server XX\data。

在數據目錄中，有幾個比較重要的子目錄，分別是：

binlog： 存放二進制日志文件；
data： 存放MySQL的數據文件；
innodb： 存放用于InnoDB存儲引擎的數據及元數據文件；
log： 存放MySQL的日志文件，如錯誤日志、慢查詢日志等；
mysql： 存放系統表、用戶權限表等系統數據；
performance_schema： 存放InnoDB及其他存儲引擎的性能監控數據。

除此之外，MySQL會在數據目錄中創建一些文件，包括：

my.cnf： MySQL的配置文件；
mysqld.pid： 存放MySQL服務器進程的PID；
ib_logfile0、ib_logfile1： 存放InnoDB存儲引擎的日志文件；
mysql.sock、mysqld.sock： 存放Unix socket文件，用于進程間通信。

當然，如果我們需要手動備份MySQL的數據文件，我們可以根據自己的需要選擇需要備份的文件，比如我們可以只備份data目錄下的數據文件。

總的來說，MySQL的數據文件存放在數據目錄中，這個目錄在不同的系統平臺上可能有所不同，一般情況下是/var/lib/mysql（Linux）或C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server XX\data（Windows）。再結合MySQL的日志文件及一些特殊文件，我們就可以全面了解MySQL的文件存儲結構。